Grisaia no Rakuen

Cerita Grisaia no Rakuen dimulai tepat setelah kejadian di Grisaia no Meikyuu. Kazami Yuuji ditangkap atas dugaan terorisme. Sebuah video merupakan bukti nyata yang menunjukkan bahwa Yuuji memang melakukan tindakan tersebut. Dia kemudian ditahan oleh Ichigaya, meskipun dia tahu betul bahwa Yuuji tidak mungkin melakukan kejahatan yang dituduhkannya. Gadis-gadis dari Akademi Mihama yang mengetahui hal itu tak bisa tinggal diam. Ketika mereka bermaksud membebaskan Yuuji, perempuan misterius yang telah lama menghilang muncul dihadapan mereka.